مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن موثر در مقاومت به خشکی wdhn13 lea) ) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ایلام - دانشکده کشاورزی
- author مهران فلک ناز
- adviser دانیال کهریزی علی اصغر نصراله نژاد قمی
- Number of pages: First 15 pages
- publication year 1390
abstract
با توجه به اینکه خشکی یکی از معضلات کشاورزی امروز است و با توجه به اینکه گندم یکی از مهمترین محصولات زراعی است و بخش مهمی از زنجیره غذایی انسان را به خود اختصاص داده و همچنین اینکه سطح زیر کشت آن در کشور ما بالاست و کشور ما نیز در کمربند خشک و نیمه خشک قرار دارد، لذا مطالعات در زمینه مقاومت به خشکی حائز اهمیت است. با توجه به اینکه توالی ژن wdhn13 که یکی از ژن های مقاومت به خشکی بوده و باعث سنتز پروتئین lea در گندم می شود تنها در گندم نان (triticum aestivum) توالی یابی شده لزوم مطالعه و انجام این طرح جهت بدست آوردن آلل های جدیدی از این ژن در گونه های زراعی و وحشی گندم از جمله گندم های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید جهت شناسایی و توالی یابی و انتقال به گونه های حساس حائز اهمیت است. در این تحقیق از گندم های زراعی نان گنبد، سرداری، دروم شوش، دروم بروجرد و گندم های وحشی اورارتو، دیکوکوئیدز، تائوشی و اسپلتوئیدز استفاده شد، که پس از pcr توسط آغازگر اختصاصی طراحی شده از روی توالی ژن wdhn13 موجود در ncbi نمونه های زراعی نان گنبد، سرداری، دوروم شوش، دوروم گنبد و همچنین گونه های زراعی اورارتو و دیکوکوئیدز ژن مورد نظر را تکثیر کردند. پس از مطالعه بیوانفورماتیکی توالی ژن wdhn13 در گندم های دارای ژن مورد نظر بر اساس توالی dna مشخص شد که توالی این ژن wdhn13 در گندم سرداری با توالی ژن wdhn13موجود در ncbi بیشترین شباهت و توالی ژن wdhn13 در گندم اورارتو کمترین شباهت را با توالی ژن wdhn13 موجود در ncbi دارد. آنالیز ها در سطح پروتئین بیانگر این بود که گندم سرداری و گندم دوروم بروجرد بیشترین شباهت و گندم اورارتو کمترین شباهت را در ارتباط با ژن wdhn13 با توالی ژن wdhn13 موجود در ncbi دارد. علت این تفاوت هم تغییرات در اسید آمینه ها بر اساس تغییرات در توالی dna نمونه ها می باشد. همردیفی از طریق نرم افزار blast و درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس الگوریتم upgma نیز موید این نتیجه بودند. همچنین درخت فیلوژنتیکی رسم شده سیر تکاملی منطقی را در ارتباط با این ژن برای اشتقاق گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید نشان داد. جدول فاصله توالی ها نیز موید این بود که نتایج blast و درخت فیلوژنتیک بر هم منطبق می باشند.
similar resources
مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn13 (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
سابقه و هدف : پروتئینهای LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئینهای تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندیهای عمومی ژنهای LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست میآید. روشهای بیو انفورماتیکی روشهای مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی میباشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn13 پروتئین های LEA درگ...
full textمطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن wdhn۱۳ (lea) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
سابقه و هدف : پروتئین های lea اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی های عمومی ژن های lea به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می آید. روش های بیو انفورماتیکی روش های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن wdhn13 پروتئین های lea درگ...
full textمطالعه بیوانفورماتیکی ژن Wdhn13 در گونههای دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش Insilco AFLP Analysis
سابقه و هدف: ژن Wdhn13 کد کننده پروتئین های گروه 2 LEA می باشد. پروتئین های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های LEA شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئینهای LEA دارد. مواد و روشها: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورما...
full textبررسی مقایسه ای توالی ژن موثر در واکنش به شوری (tasrg) در گندم های زراعی نان و دوروم و گونه های دهنده ژنومی آن ها
شوری یکی از بزرگترین عوامل محدودکننده رشد و عملکرد گیاهان زراعی از جمله گندم می¬باشد. با توجه به گسترده بودن مشکل شوری، مطالعات دقیق در زمینه درک و شناسایی ژن¬های درگیر در مکانیزم مقاومتی گیاهان در پاسخ به تنش شوری حائز اهمیت است. بررسی ها نشان داده است که ژن tasrg در تنش شوری موثر است. لذا در این تحقیق ژن tasrg در ده ژنوتیپ گندم(دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید) ردیابی و تغییرات آللی آن مورد ...
مطالعه بیوانفورماتیکی ژن wdhn۱۳ در گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید گندم با استفاده از روش insilco aflp analysis
سابقه و هدف: ژن wdhn13 کد کننده پروتئین های گروه 2 lea می باشد. پروتئین های lea اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. ساختار اولیه پروتئین های lea شامل دمین های اولیه باردار و بدون بار از آمینواسید های قطبی باقی مانده اما غیرآبدوست می باشد، که دلالت برآبدوست بودن پروتئین های lea دارد. مواد و روشها: در این تحقیق روابط فیلوژنتیکی و بیوانفورما...
full textDegenerate Four Wave Mixing in Photonic Crystal Fibers
In this study, Four Wave Mixing (FWM) characteristics in photonic crystal fibers are investigated. The effect of channel spacing, phase mismatching, and fiber length on FWM efficiency have been studied. The variation of idler frequency which obtained by this technique with pumping and signal wavelengths has been discussed. The effect of fiber dispersion has been taken into account; we obtain th...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ایلام - دانشکده کشاورزی
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023